Tests FISH pour diagnostiquer les cancers

L’hybridation in situ en fluorescence (FISH) est l’une des nombreuses techniques utilisées pour rechercher l’ADN de vos cellules, en recherchant la présence ou l’absence de gènes spécifiques ou de parties de gènes

Chromosomes sous microscope à fluorescence

Elif Bayraktar / Getty Images

De nombreux types de cancer sont associés à des anomalies génétiques connues. Et par génétique, nous ne parlons pas seulement d’hérédité. Au cours d’une vie, les cellules peuvent commettre des erreurs lors de leur division et de leur croissance. Les mutations de l’ ADN associées au cancer peuvent s’accumuler dans ces cellules.

Comment ça marche

La FISH est une technique qui utilise des sondes fluorescentes pour détecter des gènes ou des parties de gènes spécifiques (séquences d’ADN). Le personnel de laboratoire des centres médicaux et les oncologues utilisent la FISH pour évaluer les patients susceptibles d’être atteints d’un cancer et parfois pour surveiller un patient qui a déjà reçu un diagnostic de cancer et qui a été traité 

La FISH peut être réalisée à partir de différents types d’échantillons selon la localisation et le type de cancer suspecté : cellules tumorales obtenues à partir du sang périphérique, d’une biopsie de moelle osseuse ou d’une biopsie de ganglion lymphatique, et tissu fixé au formol et inclus dans la paraffine (il s’agit d’un échantillon de tissu traité en laboratoire et inclus dans une sorte de cire, le rendant plus rigide, afin qu’il puisse être découpé en fines sections et monté pour être observé au microscope).

Que signifient les lettres

Le « H » de FISH fait référence à l’hybridation. Dans l’hybridation moléculaire, une séquence d’ADN ou d’ARN marquée est utilisée comme sonde (visualisez une brique Lego rouge, si vous voulez). La sonde est utilisée pour trouver une brique Lego homologue, ou une séquence d’ADN, dans un échantillon biologique.

L’ADN de votre échantillon ressemble à des piles de briques Lego, et la plupart des briques de ces piles ne correspondent pas à notre sonde rouge. Et toutes vos briques sont soigneusement organisées en 23 paires de piles de briques, chaque pile étant plus ou moins l’un de vos chromosomes homologues appariés. Contrairement aux briques Lego, notre sonde Lego rouge est comme un aimant puissant et trouve sa correspondance sans avoir à trier les piles.

Le « F » fait référence à la fluorescence. Notre sonde rouge risque de se perdre dans les piles de briques, c’est pourquoi elle est marquée avec un colorant fluorescent coloré pour briller. Lorsqu’elle trouve sa correspondance parmi les 23 piles appariées, une étiquette fluorescente révèle son emplacement. Vous pouvez donc maintenant voir comment les chercheurs et les cliniciens peuvent utiliser la FISH pour aider à identifier où (dans quelle pile ou sur quel chromosome) se trouve un gène particulier pour un individu donné.

Le « I » et le « S » signifient in situ . Cela fait référence au fait que notre brique Lego rouge cherche sa correspondance dans l’échantillon que vous avez donné .

FISH et cancers spécifiques du sang

La FISH et d’autres procédures d’hybridation in situ sont utilisées pour diagnostiquer une variété d’anomalies chromosomiques : modifications du matériel génétique, modifications des chromosomes, notamment les suivantes :

  • Délétion : une partie d’un chromosome a disparu
  • Translocation : une partie d’un chromosome se détache et se fixe sur un autre chromosome
  • Inversion : une partie d’un chromosome se détache et se réinsère, mais dans l’ordre inverse
  • Duplication : une partie d’un chromosome est présente en trop grand nombre d’exemplaires dans la cellule

Chaque type de cancer peut avoir son propre ensemble de modifications chromosomiques et de sondes pertinentes. La FISH permet non seulement d’identifier les modifications génétiques initiales dans un processus pathologique comme le cancer, mais elle peut également être utilisée pour surveiller la réponse au traitement et la rémission de la maladie

Les modifications génétiques détectées par FISH offrent parfois des informations supplémentaires sur l’évolution probable du cancer d’un individu, en fonction de ce qui a été observé dans le passé chez des personnes atteintes du même type de cancer et de modifications génétiques similaires. Parfois, la FISH est utilisée après que le diagnostic a déjà été posé, pour recueillir des informations supplémentaires qui pourraient aider à prédire l’issue du traitement ou le meilleur traitement pour un patient.

La FISH permet d’identifier les anomalies chromosomiques dans les leucémies , notamment dans la leucémie lymphoïde chronique (LLC). Dans le cas de la leucémie lymphoïde chronique/du lymphome à petits lymphocytes, la FISH permet aux patients de déterminer leur catégorie pronostique : bon, intermédiaire ou mauvais. Dans le cas de la leucémie lymphoblastique aiguë (LAL), la génétique des cellules leucémiques peut vous renseigner sur le niveau de risque de cancer et aider à orienter les décisions thérapeutiques.

Des panels FISH sont également disponibles pour le lymphome, le myélome multiple, les troubles prolifératifs des plasmocytes et le syndrome myélodysplasique. Dans le cas du lymphome à cellules du manteau, par exemple, il existe une translocation que le FISH peut détecter, appelée GH/CCND1 t (11;14), qui est fréquemment associée à ce lymphome.

Pourquoi FISH?

L’un des avantages de la FISH est qu’elle ne doit pas être réalisée sur des cellules en cours de division active. Les tests cytogénétiques prennent généralement environ trois semaines, car les cellules cancéreuses doivent se développer dans des boîtes de Pétri pendant environ deux semaines avant de pouvoir être testées. En revanche, les résultats de la FISH sont généralement disponibles en laboratoire au bout de quelques jours

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  1. Institut national de recherche sur le génome humain. Fiche d’information sur l’hybridation in situ en fluorescence .

  2. Novello S, Barlesi F, Califano R, et al. Cancer du poumon non à petites cellules métastatique : recommandations de pratique clinique de l’ESMO pour le diagnostic, le traitement et le suivi . Ann Oncol . 2016 ; 27(suppl 5) : v1-v27. doi : 10.1093/annonc/mdw326

  3. Bibliothèque nationale de médecine des États-Unis, Genetics Home Reference. Les changements dans la structure des chromosomes peuvent-ils affecter la santé et le développement ?

  4. Gulley ML, Shea TC, Fedoriw Y. Tests génétiques pour évaluer le pronostic et prédire la réponse thérapeutique dans la leucémie myéloïde aiguë . J Mol Diagn . 2010;12(1):3-16. doi:10.2353/jmoldx.2010.090054

  5. Stevens-Kroef MJ, van den Berg E, Olde Weghuis D. Identification des anomalies chromosomiques pronostiques pertinentes dans la leucémie lymphoïde chronique à l’aide du profilage génomique basé sur des microarraysMol cytogenet . 2014;7(1):3–21. doi:10.1186/1755-8166-7-3

  6. Centre des sciences de la santé de l’Université du Texas à San Antonio, laboratoire de cytogénétique clinique et moléculaire. Panels FISH .

  7. American Cancer Society. Tests utilisés sur les échantillons de biopsie et de cytologie pour diagnostiquer le cancer.

Lectures complémentaires

  • Codes CPT des tests cytogénétiques du cancer. 

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