Флуоресцентная гибридизация in situ (FISH) — один из нескольких методов, используемых для поиска ДНК ваших клеток с целью выявления наличия или отсутствия определенных генов или частей генов.
Многие различные типы рака связаны с известными генетическими аномалиями. И под генетическими мы подразумеваем не только наследственность. В течение жизни клетки могут совершать ошибки при делении и росте. Мутации в ДНК, связанные с раком, могут накапливаться в этих клетках.
Содержание
Как это работает
FISH — это метод, который использует флуоресцентные зонды для обнаружения определенных генов или частей генов (последовательности ДНК). Персонал лабораторий медицинских центров и онкологи используют FISH для оценки пациентов, у которых может быть рак, а иногда и для наблюдения за пациентами, у которых уже диагностирован рак и которые прошли лечение.
Метод FISH можно проводить с использованием различных типов образцов в зависимости от местоположения и типа предполагаемого рака: опухолевые клетки , полученные из периферической крови, биопсии костного мозга или биопсии лимфатического узла, а также фиксированная формалином и залитая парафином ткань (это относится к образцу ткани, который обрабатывается в лаборатории и заливается в своего рода воск, что делает его более жестким, чтобы его можно было нарезать на тонкие срезы и монтировать для просмотра под микроскопом).
Что означают буквы
«H» в FISH относится к гибридизации. В молекулярной гибридизации меченая последовательность ДНК или РНК используется в качестве зонда — визуализируйте красный кирпичик Lego, если хотите. Зонд используется для поиска соответствующего кирпичика Lego или последовательности ДНК в биологическом образце.
ДНК в вашем образце — это как кучи кубиков Lego, и большинство кубиков в этих кучах не будут соответствовать нашему красному зонду. И все ваши кубики аккуратно организованы в 23 пары кубиков — каждая куча — это одна из ваших парных гомологичных хромосом, более или менее. В отличие от кубиков Lego, наш красный зонд Lego подобен сильному магниту и находит свою пару без необходимости сортировать кучи.
«F» означает флуоресценцию. Наш красный зонд может потеряться в кучах кирпичей, поэтому он помечен цветным флуоресцентным красителем, чтобы он светился. Когда он находит свое соответствие среди 23 парных куч, флуоресцентная метка показывает его местоположение. Итак, теперь вы можете увидеть, как исследователи и врачи могут использовать FISH, чтобы помочь определить, где (в какой куче или на какой хромосоме) находится конкретный ген для данного человека.
«I» и «S» обозначают in situ . Это относится к тому факту, что наш красный кирпичик Lego ищет себе пару в образце, который вы дали .
FISH и специфические виды рака крови
FISH и другие процедуры гибридизации in situ используются для диагностики различных хромосомных аномалий — изменений в генетическом материале, изменений в хромосомах, включая следующие:
- Удаление: часть хромосомы исчезает.
- Транслокация: часть одной хромосомы отрывается и прикрепляется к другой хромосоме.
- Инверсия: часть хромосомы отрывается и вставляется обратно, но в обратном порядке.
- Дублирование: часть хромосомы присутствует в слишком большом количестве копий внутри клетки.
Каждый тип рака может иметь свой собственный набор хромосомных изменений и соответствующих зондов. FISH не только помогает определить начальные генетические изменения в процессе заболевания, например, рак, но также может использоваться для мониторинга ответа на терапию и ремиссии заболевания.
Генетические изменения, обнаруженные FISH, иногда предоставляют дополнительную информацию о том, как рак человека, вероятно, будет себя вести, основываясь на том, что наблюдалось в прошлом у людей с таким же типом рака и похожими генетическими изменениями. Иногда FISH используется после того, как диагноз уже поставлен, чтобы собрать дополнительную информацию, которая может помочь предсказать результат для пациента или наилучшее лечение.
FISH может определять хромосомные аномалии при лейкозах , в том числе при хроническом лимфолейкозе (ХЛЛ). При хроническом лимфолейкозе/мелкоклеточной лимфоме FISH позволяет пациентам узнать прогностическую категорию: хорошую, промежуточную или плохую. При остром лимфобластном лейкозе (ОЛЛ) генетика лейкозных клеток может рассказать вам об уровне риска рака и помочь в принятии терапевтических решений.
Панели FISH также доступны для лимфомы, множественной миеломы, пролиферативных расстройств плазматических клеток и миелодиспластического синдрома. Например, в случае лимфомы мантийных клеток существует транслокация , которую может обнаружить FISH, называемая GH/CCND1 t (11;14), которая часто ассоциируется с этой лимфомой.
Почему РЫБА?
Преимущество FISH в том, что его не нужно проводить на активно делящихся клетках. Цитогенетическое тестирование обычно занимает около трех недель, поскольку раковые клетки должны расти в лабораторных чашках Петри около 2 недель, прежде чем их можно будет протестировать. Напротив, результаты FISH обычно доступны в лаборатории в течение нескольких дней.