FDA : de nouveaux variants du COVID-19 peuvent entraîner de faux négatifs lors des tests de diagnostic

technicien manipulant un test PCR

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Principaux points à retenir

  • La nouvelle variante du coronavirus contient des mutations génétiques qui peuvent interférer avec les tests de diagnostic.
  • Il existe un faible risque que les tests de diagnostic produisent un résultat faussement négatif.
  • Un résultat faussement négatif peut amener les gens à propager le virus sans le savoir.

Le 8 janvier, la Food and Drug Administration (FDA) a mis en garde contre le risque que les tests de dépistage du coronavirus produisent des résultats faussement négatifs en raison de variantes génétiques du virus SARS-CoV-2.  Cette annonce intervient après l’apparition au Royaume-Uni d’une nouvelle souche de COVID-19 appelée B.1.1.7, qui a également été détectée aux États-Unis.

Cette souche a suscité des inquiétudes quant à la précision des tests de réaction en chaîne par polymérase (PCR), également appelés tests moléculaires, la référence actuelle en matière de dépistage de la COVID-19. En effet, les tests PCR examinent le matériel génétique du virus, et le variant fait que ce matériel génétique a une apparence légèrement différente.

Stephen Russell, docteur en médecine, PDG et cofondateur d’Imanis Life Sciences, a expliqué à Health Life Guide que les tests PCR fonctionnent en détectant différentes parties du virus. « Le virus est essentiellement constitué d’un génome (un morceau de matériel génétique qui contient toutes les informations nécessaires à sa réplication) et d’une enveloppe protéique. Ainsi, le test de diagnostic se fixe soit sur le génome, soit sur l’enveloppe protéique. »

Un test PCR examine le génome.

« Le matériel génétique du coronavirus contient environ 30 000 « bases », et les tests PCR en détectent moins d’une centaine », explique Russell. « Il manque un peu de séquence au variant britannique, et il a perdu deux acides aminés. Cela signifie que six de ces 30 000 bases du génome viral ont disparu. Et c’est là que certains de ces tests PCR se fixent sur le virus. Ainsi, la présence du variant peut transformer un test positif en test négatif. »

Les variants de la COVID-19 rendent-ils les tests de diagnostic moins fiables ?

Russell explique que les différents tests PCR reposent sur des bases différentes pour recueillir les informations génétiques du virus, de sorte que les tests de diagnostic ne sont pas totalement incertains. La FDA s’attend à ce que le SARS-CoV-2 continue de muter et a autorisé des tests de diagnostic qui peuvent cibler plusieurs mutations génétiques. Cela réduit le risque de recevoir un faux négatif.

« La précision des tests a toujours été une source de préoccupation. Il n’existe aucun test qui ne donne pas de faux négatifs et qui ne donne pas de faux positifs », explique Russell. Il ajoute que la technique de prélèvement, la taille de l’échantillon et la façon dont l’échantillon est traité en laboratoire peuvent créer une variabilité.

« Je ne pense pas que les nouvelles variantes fassent une réelle différence en termes de fiabilité [des tests] à ce stade », dit-il.

Quels tests peuvent produire un faux négatif ?

La FDA indique que trois tests de diagnostic COVID-19 basés sur la PCR – qui bénéficient chacun d’une autorisation d’utilisation d’urgence – comportent un faible risque de produire un faux négatif. 

  • Test Accula SARS-Cov-2
  • Kit combiné TaqPath COVID-19
  • Kit d’analyse Linea COVID-19

Cependant, la FDA affirme que, comme les tests TaqPath et Linea se verrouillent sur plusieurs cibles génétiques, la nouvelle variante ne devrait pas entraver la sensibilité globale du test.

Ce que cela signifie pour vous

Si vous pensez avoir été exposé à la COVID-19, faites-vous tester. Même si les risques d’obtenir un faux négatif sont faibles, vous devez continuer à agir avec prudence et à vous mettre en quarantaine pendant au moins 14 jours.

Que devraient faire les gens ?

L’une des conséquences majeures d’un résultat faussement négatif sur la santé publique est que les personnes qui pensent ne pas avoir contracté la COVID-19 peuvent transmettre le virus à d’autres personnes sans le savoir. « Si votre test est négatif, cela ne signifie pas que vous êtes définitivement négatif », explique Russell. « Si vous avez un fort indice de suspicion que vous pourriez toujours être positif, ne présumez pas que ce test est la réponse définitive. »

Il ne recommande toutefois pas de se faire tester chaque semaine, à moins que votre travail ne l’exige ou que vous ne présentiez un risque élevé pour les autres. Pour l’instant, Russell estime que la meilleure chose à faire est de se faire vacciner dès que les vaccins seront disponibles.

Si les gens soupçonnent toujours une infection même après la vaccination ou plusieurs tests négatifs, Russell dit qu’il pourrait être utile de faire un test d’anticorps pour avoir l’esprit tranquille.

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  1. Food & Drug Administration des États-Unis. Des variantes génétiques du SARS-CoV-2 peuvent conduire à des résultats faussement négatifs avec des tests moléculaires pour la détection du SARS-CoV-2 . 8 janvier 2021.

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